Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt27Q9Z320 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt27Q9Z320 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt27Q9Z320 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms