Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tsc22d3Q9Z2S7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms