Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mbd3Q9Z2D8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mbd3Q9Z2D8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mbd3Q9Z2D8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms