Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Nup160Q9Z0W3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Nup160Q9Z0W3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Nup160Q9Z0W3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Nup160Q9Z0W3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Nup160Q9Z0W3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms