Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itgb6Q9Z0T9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb6Q9Z0T9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb6Q9Z0T9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms