Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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AireQ9Z0E3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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AireQ9Z0E3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
AireQ9Z0E3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AireQ9Z0E3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AireQ9Z0E3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AireQ9Z0E3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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AireQ9Z0E3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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AireQ9Z0E3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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AireQ9Z0E3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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AireQ9Z0E3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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AireQ9Z0E3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AireQ9Z0E3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AireQ9Z0E3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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AireQ9Z0E3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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AireQ9Z0E3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AireQ9Z0E3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AireQ9Z0E3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AireQ9Z0E3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AireQ9Z0E3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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AireQ9Z0E3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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AireQ9Z0E3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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AireQ9Z0E3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AireQ9Z0E3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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