Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL6

Extl3, Exostosin-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl3Q9WVL6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Extl3Q9WVL6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Extl3Q9WVL6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Extl3Q9WVL6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms