Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plod2Q9R0B9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Plod2Q9R0B9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Plod2Q9R0B9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.5 ms