Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpc1Q9QZF2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpc1Q9QZF2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpc1Q9QZF2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc1Q9QZF2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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