Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cbx8Q9QXV1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cbx8Q9QXV1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cbx8Q9QXV1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 746.2 ms