Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad18Q9QXK2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad18Q9QXK2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad18Q9QXK2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad18Q9QXK2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad18Q9QXK2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad18Q9QXK2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad18Q9QXK2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad18Q9QXK2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad18Q9QXK2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad18Q9QXK2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad18Q9QXK2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad18Q9QXK2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad18Q9QXK2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad18Q9QXK2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad18Q9QXK2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad18Q9QXK2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad18Q9QXK2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rad18Q9QXK2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad18Q9QXK2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms