Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lsm4Q9QXA5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lsm4Q9QXA5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lsm4Q9QXA5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms