Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dkk3Q9QUN9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dkk3Q9QUN9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dkk3Q9QUN9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dkk3Q9QUN9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Dkk3Q9QUN9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms