Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm2bQ9JME9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vstm2bQ9JME9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vstm2bQ9JME9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vstm2bQ9JME9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vstm2bQ9JME9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Vstm2bQ9JME9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vstm2bQ9JME9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vstm2bQ9JME9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vstm2bQ9JME9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vstm2bQ9JME9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vstm2bQ9JME9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vstm2bQ9JME9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vstm2bQ9JME9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vstm2bQ9JME9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vstm2bQ9JME9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vstm2bQ9JME9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms