Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sfmbt1Q9JMD1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfmbt1Q9JMD1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sfmbt1Q9JMD1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms