Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gkap1Q9JMB0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gkap1Q9JMB0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gkap1Q9JMB0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gkap1Q9JMB0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms