Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpa33Q9JKA5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms