Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnga3Q9JJZ8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnga3Q9JJZ8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnga3Q9JJZ8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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