Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bco1Q9JJS6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bco1Q9JJS6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms