Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccl28Q9JIL2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl28Q9JIL2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccl28Q9JIL2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms