Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmod3Q9JHJ0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmod3Q9JHJ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmod3Q9JHJ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmod3Q9JHJ0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms