Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI5

Ppbp, Chemokine (C-X-C motif) ligand 7, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpbpQ9EQI5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpbpQ9EQI5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpbpQ9EQI5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpbpQ9EQI5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PpbpQ9EQI5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpbpQ9EQI5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpbpQ9EQI5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpbpQ9EQI5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpbpQ9EQI5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpbpQ9EQI5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PpbpQ9EQI5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpbpQ9EQI5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PpbpQ9EQI5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PpbpQ9EQI5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PpbpQ9EQI5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PpbpQ9EQI5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PpbpQ9EQI5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 349.6 ms