Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r44Q9EQ47 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r44Q9EQ47 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms