Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cpsf1Q9EPU4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cpsf1Q9EPU4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cpsf1Q9EPU4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cpsf1Q9EPU4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cpsf1Q9EPU4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cpsf1Q9EPU4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cpsf1Q9EPU4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cpsf1Q9EPU4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cpsf1Q9EPU4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cpsf1Q9EPU4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cpsf1Q9EPU4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms