Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx6Q9DBY5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx6Q9DBY5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms