Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph3bQ9DA80 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph3bQ9DA80 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rsph3bQ9DA80 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph3bQ9DA80 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms