Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn34b2Q9D9N2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn34b2Q9D9N2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms