Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Alkbh4Q9D8F1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Alkbh4Q9D8F1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms