Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tspan17Q9D7W4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan17Q9D7W4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms