Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmigd1Q9D7L8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmigd1Q9D7L8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 222.7 ms