Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9D5Q8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9D5Q8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D5Q8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D5Q8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D5Q8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D5Q8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D5Q8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D5Q8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D5Q8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D5Q8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9D5Q8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D5Q8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D5Q8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D5Q8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9D5Q8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D5Q8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D5Q8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D5Q8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9D5Q8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9D5Q8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms