Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D4W2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D4W2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D4W2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D4W2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D4W2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D4W2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D4W2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D4W2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D4W2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D4W2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D4W2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D4W2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D4W2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D4W2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D4W2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D4W2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D4W2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D4W2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D4W2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D4W2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D4W2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D4W2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D4W2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D4W2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D4W2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D4W2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D4W2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D4W2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D4W2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D4W2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D4W2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms