Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Taf1dQ9D4V4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Taf1dQ9D4V4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Taf1dQ9D4V4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Taf1dQ9D4V4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Taf1dQ9D4V4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Taf1dQ9D4V4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Taf1dQ9D4V4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms