Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V8

Fam227a, Family with sequence similarity 227, member A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227aQ9D3V8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam227aQ9D3V8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam227aQ9D3V8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam227aQ9D3V8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms