Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vsig1Q9D2J4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vsig1Q9D2J4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vsig1Q9D2J4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vsig1Q9D2J4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms