Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E1

Tssk3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk3Q9D2E1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms