Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chordc1Q9D1P4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chordc1Q9D1P4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms