Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M4

Eef1e1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eef1e1Q9D1M4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eef1e1Q9D1M4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eef1e1Q9D1M4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eef1e1Q9D1M4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eef1e1Q9D1M4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eef1e1Q9D1M4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eef1e1Q9D1M4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Eef1e1Q9D1M4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eef1e1Q9D1M4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Eef1e1Q9D1M4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms