Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D1F3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D1F3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D1F3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D1F3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D1F3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D1F3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9D1F3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D1F3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D1F3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D1F3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D1F3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D1F3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D1F3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D1F3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D1F3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms