Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr3eQ9CZT4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr3eQ9CZT4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr3eQ9CZT4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms