Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shmt2Q9CZN7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shmt2Q9CZN7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Shmt2Q9CZN7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Shmt2Q9CZN7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Shmt2Q9CZN7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.7 ms