Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nde1Q9CZA6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nde1Q9CZA6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nde1Q9CZA6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms