Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hdhd3Q9CYW4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdhd3Q9CYW4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdhd3Q9CYW4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms