Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Prkrip1Q9CWV6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prkrip1Q9CWV6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prkrip1Q9CWV6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms