Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930553M12RikQ9CUH1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930553M12RikQ9CUH1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930553M12RikQ9CUH1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930553M12RikQ9CUH1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930553M12RikQ9CUH1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930553M12RikQ9CUH1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930553M12RikQ9CUH1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930553M12RikQ9CUH1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930553M12RikQ9CUH1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930553M12RikQ9CUH1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930553M12RikQ9CUH1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930553M12RikQ9CUH1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930553M12RikQ9CUH1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930553M12RikQ9CUH1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930553M12RikQ9CUH1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4930553M12RikQ9CUH1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms