Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snw1Q9CSN1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snw1Q9CSN1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snw1Q9CSN1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snw1Q9CSN1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms