Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc96Q9CR92 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc96Q9CR92 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.9 ms