Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gadd45gip1Q9CR59 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gadd45gip1Q9CR59 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms