Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smim8Q9CQQ0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms