Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc2Q9CQP2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc2Q9CQP2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc2Q9CQP2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms